熵茧破碎后的宇宙弥漫着劫后余生的气息，星盟的重建工作如火如荼。然而，阿依娜的银链监测器再次发出尖锐警报，链身新刻的史诗纹路泛起诡异的紫光。“检测到宇宙各处出现‘熵能孢子’，”她的声音带着难以掩饰的惊恐，全息星图上，无数暗红色的斑点如瘟疫般扩散，“这些孢子以暗物质为土壤，正在吞噬周围星系的生命力。”
林羽的无界之琴剧烈震颤，琴身裂痕中渗出的暗金色液体与孢子产生共鸣。归墟钥星尘在他周身形成的荆棘锁链开始松动，他的意识深处，圣人虚影们的声音充满绝望：“那是熵影之主的‘终焉种子’……一旦完全萌发，整个宇宙将沦为死寂的苗圃……”沈梦璃握紧镇魔剑，剑身的变数剑意符文黯淡无光，剑柄处的九州龙脉符文彻底碎裂。
星盟紧急组建“清剿舰队”，但舰队在接近孢子区域时遭遇诡异现象。战舰的能源系统自动转化为滋养孢子的养分，船员们的思维被植入“服从生长”的指令。半人马座先知的水晶球炸裂，碎片拼凑出模糊的画面：暗金色的巨树从宇宙深处拔地而起，根系缠绕着无数星系，树冠遮蔽所有星光。
林羽带领特遣队驾驶经过二次改造的“新芽号”，船体表面覆盖着由律源核心能量与混沌初声交织而成的“逆生装甲”。当飞船驶入孢子最密集的区域，舱内温度骤降至绝对零度，所有物质开始逆向生长——金属变回矿石，生命退化为单细胞形态。声波族战士的喉咙长出晶体，无法发出任何声音；灵脉使的能量丝线倒灌回体内，引发剧烈反噬。
在一片被孢子吞噬的星系残骸中，他们发现了“熵能苗圃”。暗金色的藤蔓如巨蟒般缠绕着恒星，每片叶子都在吞吐着文明的残片。黑袍人的实体从藤蔓中走出，他的皮肤布满树纹，手中握着由孢子凝聚的“腐化权杖”。“欢迎来到新秩序的温床，”他狞笑着挥动权杖，藤蔓瞬间化作尖刺射向新芽号，“熵影之主将在这里培育出最完美的寂静森林。”
腐化权杖释放的孢子云接触逆生装甲的瞬间，装甲表面开始结晶化。林羽的无界之琴奏出抗争的旋律，却被孢子吸收转化为生长激素。沈梦璃挥剑斩断藤蔓，剑刃却被腐蚀出孔洞；阿依娜的银链释放净化波，反而加速了孢子的分裂。更可怕的是，特遣队队员们的身体开始出现孢子化征兆，皮肤长出暗金色纹路。
“这些孢子能同化一切异质能量！”林羽的意识沉入无界之琴，在混沌与秩序的交界处，他看到了孢子的致命缺陷——过度依赖吞噬的生长模式，导致其无法抵御真正的“新生之力”。“阿依娜，分析孢子的核心频率！沈梦璃，准备用剑意点燃生命火种！”他将苍生之力注入星尘，凝聚成一把由所有文明新生瞬间记忆构成的“破晓之镰”。
阿依娜的银链疯狂缠绕在量子分析仪上，终于发现孢子的核心频率与“毁灭”共振。沈梦璃燃烧生命本源，施展出能点燃希望的“星火燎原式”，剑影如绽放的烟火驱散黑暗。林羽挥动破晓之镰，镰刀上闪烁着婴儿的第一声啼哭、文明的第一次科技突破、跨越星海的第一次握手。
当破晓之镰斩向熵能苗圃的根茎，黑袍人发出绝望的嘶吼，腐化权杖寸寸碎裂。但苗圃核心突然爆发强光，熵影之主的意识化作参天巨树，树根深深扎入宇宙的核心，树冠遮蔽半个银河系。“你们以为新生能战胜腐朽？”祂的声音让空间扭曲，“看清楚吧，这宇宙的终点，唯有永恒的生长与凋零！”
千钧一发之际，林羽感受到宇宙中传来的万千回响。那些在孢子侵蚀下顽强求生的文明，用最后的力量传递信念。地球的修道者以灵脉为引，点燃生命篝火；外星种族用生物电波编织希望网络；硅基联盟将所有算力转化为新生代码。这些力量注入破晓之镰，镰刀绽放出照亮宇宙的光芒。
光芒与巨树激烈碰撞，产生的能量风暴席卷整个星系团。黑袍人的身体在光芒中彻底消散，熵影之主的巨树出现无数裂痕。当光芒达到顶点，巨树轰然倒塌，释放出被囚禁的星系。但在尘埃落定后，林羽看到宇宙深处仍有零星的孢子在飘荡，熵影之主的核心意识化作无数暗金色种子，坠入未知角落。
新芽号带着胜利的曙光返回星盟，各星系开始新一轮的重生。林羽的无界之琴裂痕中长出翠绿的新芽，琴身镶嵌着所有文明新生的希望；阿依娜的银链重新锻造，链身刻满对抗腐化的诗篇；沈梦璃的镇魔剑在修复中融入了“星火剑意”。他们知道，熵影之主的威胁永远不会彻底消失，但只要文明的生命力如同新芽般顽强，每一次黑暗的侵袭，都将成为孕育光明的养料。而在宇宙的某个超维缝隙中，暗金色的种子正在积蓄力量，等待着下一次破土而出的时刻……